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Os herbicidas não são maus nem bons, mas são demasiado eficazes e prejudiciais para toda a vida selvagem. Os SynComs são muito parecidos com eles – também podem fazer tanto mal como bem. Ao mesmo tempo, as comunidades microbianas em contacto com outras criaturas microscópicas no solo muitas vezes não sobrevivem à competição e morrem. É por isso que são necessários herbicidas, para suprimir a atividade dos micróbios existentes e aumentar as hipóteses de os conjuntos sintéticos os derrotarem.
